Хм, могу согласиться, что можно и не добежать, но все же сделать это сложно. На какой сложности играете? Финальный коридор к двери довольно суров, на Ветеране я прошел его раза с 300. Старайтесь быстрее продвигаться к цели, используйте световые гранаты. Самое главное особенно нигде не задерживаться, ибо враги в некоторых местах регенерируются, пока вы не сдвинитесь с места.
В самом командном пункте главное быстро найти светящийся пульт, если остаются последние секунды.
Но это все скорее отговорки, перестреляйте всех и вперед. Так как предпоследний этап использует общее время на все чекпоинты, то возможно вы где-то тормозили в начале, после чего не хватило времени. Попробуйте начать с начала этапа, там не так уж много. Также можно понизить сложность из меню можно будет играть смелее.